第１章　３・１１本当は何が起こったか：巨大津波と福島原発―早期収束の具体的提案（これまで地震の発生原理はどのように考えられてきたか
今回の地震は「構造浸食型地震」　ほか）
第２章　白熱！止まらない質疑応答（人間とほかの生物では、被曝の影響に違いがあるのか？
組織を動かすには何が必要なのか？　ほか）
第３章　生徒たちが考える「東日本大震災」２篇（東日本大震災と向き合う―「学ぶ」と「生きる」を問い直す
震災から今日までの日々を振り返る）
第４章　なぜ自ら学ぼうとする子どもが育つのか（ヨハネ研究の森と丸山茂徳先生の出会い
なぜ学校に意味が見出せなくなったのか　ほか）