何カ国にも支部を持つ名門『Ｎｏｒｔｈｅｒｎ　Ｌｉｇｈｔｓ　Ｃｏｌｌｅｇｅ』―そこは人界に潜む悪魔を狩る天使の子らが集う教育機関。１７歳のレオは、ペアリングのため東京支部へ編入することになった。天使は男性体だが、番う相手により男性性『Ｙ』か女性性『Ｘ』かの役割が決まる両性具有。出生率が低下しているため恋愛は禁じられ、相手は上層部が決定するペアリングで定められる。幸いレオはこれまで誰とも組まされずにきたが、望まない『Ｘ』を言い渡された上、相手は御影響という技能は優秀だが問題が多い男で…！？