ショタな外見とは裏腹にその頭の中は極上のマッド・サイエンティストである、天才少年・久我原桂一。彼が最終目標である「世界征服」を達成するために選んだ手段は、なぜか民間警察（プライベート・ポリス）「シャムロック・カウンシル」の創設だった！しかも制服はエプロンドレス！？なんで！？暴走する桂一を止めるはずの十六夜学院生徒会の中瀬古舞と藤堂乱菊の二人まで、いつの間にかシャムロックのメンバーに入れられてしまい、さらにはコスプレオタク美少女のクリスまで参入してしまったからさぁ大変！そんな彼らに降りかかる大事件とは…。