ＮＣＴ研究所陥落を阻止したものの、遺産の情報を奪われてしまった由宇たち。失意の由宇をあざ笑うかのように黒川は暗躍する。驚異の遺産の力、マモンの頭脳、黒川の謀略の前に、遺産犯罪組織や国家はあまりにも無力だった。多数の死者が出る一方、世論には黒川を英雄視する向きも出てくる。心揺らぐ由宇だったが、そんな彼女を闘真と麻耶は励ますのだった。そして…。米国第四艦隊が沈没したフリーダムをサルベージしようとするこの時、由宇はここを決戦の場に選んだ。必ず黒川はやって来る。世界最高峰の頭脳と冷酷な悪魔の最後の戦いが、ついに始まった。