幻獣の急襲を受け、一時は浮き足だった人類側だったが、善行が大規模な戦闘団を組織することで山口に防衛線を張りなんとか踏みとどまる。だが、急拵えの隊である上に軍人らの思惑も絡み、内部で軋轢が生じ始める。さらに、新たに５１２１の司令となった舞の言動に、小隊内でも不満が募っていく。そんな最中、二号機が被弾、大破。敵の真っ只中で、滝川が動かぬ軽装甲と共に孤立した。新たな指令幻獣の出現。暗躍する共生派の脅威。善行戦闘団、そして５１２１小隊に反撃の秘策はあるのか…？！ＳＣＥ＆芝村氏監修の元、伝説の小隊がオリジナルストーリーで蘇る。