「一航戦、赤城、出ます！」「加賀、続く！」本日も出撃、演習、遠征に明け暮れる鎮守府の艦娘たち。赤城率いる第一艦隊が西方打通作戦の先陣を切る一方、北方海域より鬼級、姫級を含む深海棲艦の大部隊が侵攻を開始する。急いで鎮守府へと帰還しようとする第一艦隊だったが、潜水艦による待ち伏せ攻撃に遭い、赤城と加賀が大破してしまう！絶体絶命の状況の中、提督が打ち出した作戦とは―！？艦娘総動員の大決戦が幕を開ける！！