工兵、次郎丸、梅林ＶＳ立華、藤崎の対決となった総合商社二社のインフラ統合案件は、暗躍するスピリッティア、貝塚の介入もあり、業界全体を巻き込む事態に。国内の主要なＩＴ企業を押えられ、案件を進める術を失った工兵が目を向けたのは…まさかのあの人物！？一方、工兵の総務部への異動話も待ったなしの状況に。スルガシステムの未来と、立華のいるＳＥ部を守ること、そして自身のエンジニアとしてのキャリアに悩む工兵の選ぶ道とは―。萌えるＳＥ残酷物語、感動のシリーズ本編完結編！