時は西暦2036年。ついに死都・東京へ姿を現したコッペリオン開発者・Dr.コッペリウス──。圧倒的に不利な状況下で、小津姉妹たちは2年生との直接対決に挑む！！　果たして、敵に捕らわれた荊と葵を救出することはできるのか……！？