天才少女船長キラと動物乗組員達が乗り込んだ宇宙貨物船ブレーメンII号。次の寄航地では狂信的な教団による誘拐事件に立ち向かう。超新星爆発までのタイムリミットはあとわずか…無事救出なるか？