壊滅した学園の医務室で目覚めた隼人は、起死回生の切り札「ＩＰＳウイルス兵器」の使用に望みを託す。だが兵器の発動には隼人と令の命を賭けた決断が必要だった。互いを失う恐怖に直面する二人。そこへ舞い込んだ宿敵さやかからのメールが、隼人たちを否応なく戦場へ突き動かす！超進化生物への鮮やかな反撃を描く、神速の学園バトルラブコメディ、覚醒の第３弾。