幼い頃に見た領主様に憧れて「正義の騎士」を目指す少女エマ。試作実験機「アタランテ」のテストパイロットである彼女は、母艦の軽空母「メレア」の改装のため第七兵器工場へと訪れる。メレアの「里帰り」を歓迎する第七兵工場のスタッフだけど、第三兵器工場のスタッフであるアタランテ開発チームとは険悪な様子。「マッド・ジーニアス」と呼ばれる変わり者の技術者も現れて―「この機体は駄目ね。欠陥機だから、降りた方がいいわよ」アタランテ開発中止の危機に！？さらにアタランテを狙う組織も暗躍し…！？落ちこぼれの少女騎士が成り上がる「星間国家」英雄譚、待望の第２幕！！