十年前に突如として現れた巨大な“悪魔”。歪な翼を持つ漆黒の異形存在である彼らによって、世界は壊滅状態となる。人類は“悪魔”に唯一対抗できる特殊能力を持つ子供たちを研究機関・神智学院に集め、ささやかな抵抗をしながら、死と隣合わせの中、なんとか生き延びていた。神智学院に通うイザヤは、かつて“悪魔”に左腕を喰われ、忌むべき力を宿す少年。ある日、謎の少女アナに出会った彼は、驚愕の現象に巻き込まれる―。「何度もわたしを救おうとしてくれて、ありがとうイザヤくん」これは、無限に繰り返される絶望的な運命に挑む、不屈の少年の物語。