アフリカを出た人類の祖先は、いかにして日本列島にたどりつき「ヤポネシア人」となったのか？中国人や東南アジア人ともかけ離れた、縄文人のＤＮＡの特異性とは？また、縄文人・弥生人とも異なる集団は存在したのか？さまざまな証拠を組み合わせて導かれる日本人の実像とは？先端科学を駆使して、日本列島人２０万年の旅のミステリーに挑む！

１章　ヒトの起源―猿人、原人、旧人、新人…人類はいかに進化してきたのか
２章　出アフリカ―日本人の祖先は、アフリカ大陸からどう移動していったのか
３章　最初のヤポネシア人―日本列島に住むわれわれの源流を探るアプローチ法とは
４章　ヤポネシア人の二重構造―縄文人と弥生人は、いつ、どのように分布したのか
５章　ヤマト人のうちなる二重構造―従来の縄文人・弥生人とは異なる「第三の集団」の謎
６章　多様な手法による源流さがし―Ｙ染色体、ミトコンドリア、血液型、言語、地名から探る