一六世紀後半から一七世紀、長崎・平戸は世界航路の結節点となり、海外貿易の町＝港市（こうし）として形成された。平戸のオランダ商館跡、長崎の旧六町・出島・唐人屋敷・長崎奉行所跡等の最新の発掘成果から、世界にひらかれた港市のダイナミックな歴史に迫る。

第１章　港市遺跡としての長崎・平戸（長崎奉行所正門階段の発見
「長崎遺跡群」の提唱
港市貿易の町、長崎・平戸）
第２章　長崎以前の港市・平戸（倭寇の時代
中国人海商とポルトガル船の時代
オランダ商館の時代）
第３章　港市・長崎の展開（「諸民族雑居」の空間
ポルトガル貿易とキリシタン
出島とオランダ貿易
唐人屋敷と中国貿易
港市の要・長崎奉行所）
第４章　世界航路と長崎・平戸（倉庫と沈没船
長崎・平戸の流通資料
世界航路への結節点）