本書は第一部で「除痘館記録」の影印（原本図版）・翻刻・現代語訳・註と解説、第二部に論考を配し、幕末という当時の歴史的背景や具体相、あるいは洪庵を取り巻く状況や環境などを丁寧に解説することで、より多くの人々が緒方洪庵と除痘館事業の活動を再認識できるよう構成した。病いとの闘いに迫る書。

第１部　「除痘館記録」を読む（「除痘館記録」の影印
「除痘館記録」の翻刻・読解
現代語訳「除痘館記録」
「除痘館記録」の註と解説）
第２部　天然痘対策と除痘館活動（天然痘対策と緒方洪庵（天然痘との闘い―種痘法の開発と根絶宣言への道
緒方洪庵と「除痘館記録」）
大阪の除痘館の成立と展開（モーニケ苗の伝来と展開
大阪の除痘館の成立
大阪の除痘館の活動と官許
尼崎町除痘館の創成と展開）
牛痘種痘法の意義と役割（エドワード・ジェンナーによる牛痘種痘法の開発
天然痘対策の今日的意義））