『門』の開通により再び日本と繋がった特地。海上自衛隊の江田島五郎一佐と徳島甫二曹は、海に浮かぶ船団アトランティアに囚われていた姫君プリメーラ・ルナ・アヴィオンの救出に成功した。そんな中、日本が帝国から委譲された特地の諸島が、アトランティア軍に侵略される事態が起こる。これに対し日本政府は即座に自衛権を発動し、海上自衛隊が諸島奪還に乗り出すが…ついにアトランティア崩壊へ―混迷極める特地の海で、海自徳島＆江田島、更に陸自伊丹耀司達の大作戦が動き出す！累計５００万部の異世界×自衛隊ファンタジーシーズン２、待望の最終章！