かつて凄惨な連続殺人がおこなわれたホテル「オペラ座館」。新たに作り直された劇場での完成記念公演に、名探偵の孫・金田一一と七瀬美雪は招かれる。その舞台では悲劇『オペラ座の怪人』になぞらえた凶行がまたも起きてしまう。ハジメは「ジッチャンの名にかけて」ファントムと名乗る殺人犯の正体を暴く！