誰一人欠けることなく五年生になったオリバーたち剣花団。彼らはそれぞれ、その幸せを噛みしめ、卒業後の進路を考え切磋琢磨を続けていた…復讐の火を胸に宿す、青年ただ一人を除いて。「律する天の下」の大接近が迫り、キンバリー教師陣も防衛のため連合各地へと派遣されることになるが、それは異端の導師たちが仕組んだ巧妙な罠で―「構えなさい皆さん！戦争ですよォ！」かつてない危機を迎える魔法学校。空を覆い尽くす異端の幾何学の下で、オリバーやナナオたち学生は最前線で敵を迎え撃つことになる。果たして戦いの行く末は？そして、剣花団の命運は…？