暴走した電子ネットワークは超自然の領域と接続され、古のニンジャソウルが人々を超人化させる現象が多発。さらにはセト、明智光秀、ブラド・ツェペシュ……　半神的存在であったリアルニンジャ達が眠りから目覚め、古事記に予言されし最終戦争の刻が到来せんとしていた。謎めいたニンジャ「サツガイ」の手で幼馴染を殺され、自らも致命傷を負った青年「マスラダ・カイ」は、太古の邪悪「ナラク・ニンジャ」のソウルを憑依させ、復讐の戦士「ニンジャスレイヤー」として蘇る。同じ頃、先代「ニンジャスレイヤー」フジキド・ケンジは、国際探偵として異国の地を巡り、新たな戦いに身を投じていた。ニンジャスレイヤー新章「エイジ・オブ・マッポーカリプス」開幕！巻末収録のニンジャ名鑑フルカラー版ＰＤＦがダウンロードできる特典付き！紙書籍初回版限定『ニンジャスレイヤーＴＣＧ』ＰＲカード＆マスラダ・カイが封入予定