１９６９年、全世界が人類初の月ロケット、アポロ１１号打ち上げに歓声をあげるなか、もうひとつの宇宙船が密かに地球を飛び立っていた。１９世紀末北極で発見された巨大な機械生命体の調査研究をもとに建造されたゴースト１号。だがそのテスト中、新型エンジンが暴走、気がつくと彼らは何処とも知れぬ銀河のただなかに…そこでは敵対する２つの機械生命体―サイバトロンとデストロンの壮絶なる戦いが繰り広げられていた。