ゆくえふめいになったぼくじょうぬしをさがすため、とかいにやってきたショーンとなかまたち。ところが、ショーンとピッツァーはいじわるなやくにんにつかまって、どうぶつしゅうようセンターにとじこめられてしまいます。このセンターからだっしゅつできたどうぶつはいままで１ぴきもいません。そう、１ぴきも！ショーンとピッツァーはぶじにげだすことができるのでしょうか。

行方不明になってしまった牧場主を探すため、ショーンたちが大都会に繰り出した。みんなで無事に、牧場へ帰れるのだろうか？