「ギルガメシュ、君は何を求めて旅をするの？」女神に見初められし少年と、現代からやって来た少年。ひとりは不死を求め、また一方は消えた幼馴染みを追うために……。熱い想いを抱き、2人の少年の旅はつづく───!!　イシュタルの登場、そしてエンキドゥの死…。旅の途中、サソリの毒に倒れたシンは過去の真実を知る。ギルガメシュを手に入れたいイシュタルと、玲音奈を取り戻したいシン。それぞれの苦悩や思惑が交錯したまま、ギルガメシュとシンは旅を再開する。そして2人の前に現れた人物が、また新たな展開を巻き起こし──!?