昼空を龍が飛び、夜空を大こうもりが飛び、隅田川には大みずち、飛鳥山には化け狐、城には巨大なガイコツ・がしゃどくろがすむ妖怪都市・大江戸。そこに、ただひとりの人間として落ちてきた少年は、かわら版屋に職を得て、妖怪達と暮らし始めた…。