「ありがとう、ストーカー。貴様のせいで遅刻と赤点を免れた」巨大生物の襲来から五年―上司を殴って軍をクビになった桐生矢城は、親友葵闘神の頼みで高校生の妹ハルカを守ることに。テストでカンペ、トイレにウォシュレットを置き無事を見守るが“良いストーカー”扱いされてしまう。そんな矢城だが、闘神が行方不明と聞き、救出するためハルカと再び戦場へ向かう。最大の武器は葵家が開発した戦闘用魔導アーマーと、その適合者で！？