完全体になったキラ＋ソフト・ブレイドと、“ウォールフィッシュ”号の乗組員たちは、エイリアンの戦艦に決死の覚悟で乗り込んでいく。新たな敵、仲間との再会。自分たちの選択は正しかったのか？迷いながらも強敵に立ち向かうキラは、本当に自分がやるべきことの答えを見出す。この果てしない宇宙のために…。