九條キリヤ。通称『暗号解読士』。類い稀なるセンスで事件現場に残された暗号を解き、難解な事件をいくつも解決に導いてきた警察の民間人協力者―。担当する殺人事件の捜査のため、キリヤの協力を仰ぐことになった警視庁の新米刑事・七瀬光莉。驚くほどの美形だが、無愛想で毒舌家なキリヤとともに調査を進める光莉は、その最中、何者かに襲われてしまう…。他人との深い関わりを拒みながらも、暗号に隠された思いや願いを解き放つ大学生キリヤ。彼が抱える過去、そして“最期の言葉”とは？暗号解読ミステリー、登場！