鉱産資源に満ちた惑星キオネー。その地下には、かつて異星人が築いた古代都市が眠っていることが判明した。奇妙な遺跡が立ち並び、発光する物質で埋め尽くされた神秘の領域…調査に向かった学者デヴィッド・セレダたちは、遺跡の発見者から襲撃を受ける。遺跡が真にもたらすものは考古学的な発見ではなかった…足を踏み入れた者たちを魅了し、正気を奪い、悲劇へ誘う、ゼノモーフの巣窟なのだ！「エイリアンＶＳプレデター３」以前にデヴィッド・セレダが体験した惨劇が今、明らかになる…