サンプル調製やデータ解析で陥りがちなピットフォールを攻略し、ヒト微生物叢の本来の姿を捉える。

第１章　マイクロバイオーム研究をはじめる前に考えること（ヒトマイクロバイオーム研究の全体像（服部正平）
データベースの意義とその整備（黒川顕）
細菌の分類と命名（坂本光央））
第２章　腸内微生物叢のマイクロバイオームデータの生産（微生物叢ＤＮＡの抽出技術の開発状況および酵素法プロトコール（服部正平
小宮恵子）
腸内細菌叢ＤＮＡの抽出技術（ビーズ法プロトコール）およびライブラリ調製（関口勇地）　ほか）
第３章　その他の微生物叢のマイクロバイオームデータの生産（皮膚細菌叢のマイクロバイオーム解析（松岡悠美）
唾液微生物叢のショットガンメタゲノム解析（矢原耕史）　ほか）
第４章　細菌株の性質の解析（菌株単離・培養と選定・釣菌、保存（成島聖子
坂本光央））
第５章　マイクロバイオームデータの関連解析（ヒト遺伝子―塩基多型（ＳＮＰ）とマイクロバイオームの関連解析（北岡寛己
友藤嘉彦
岡田随象）
環境因子（食事、生活習慣、薬剤）や疾患とヒトマイクロバイオームの関連解析（西嶋傑
永田尚義））