第１章　新学術領域「多元計算解剖学」序論
第２章　多元計算解剖学の基礎（多元計算解剖学を支える技術）（多元計算解剖学の目的
生体画像技術
ミクロ３次元画像化技術　ほか）
第３章　多元計算解剖学の学術展開（解剖学・微細形態学への学術展開
病理学への学術展開
生理学への学術展開　ほか）
第４章　多元計算解剖学の臨床研究への応用（画像診断学への臨床応用
脳科学への臨床応用
脳機能標準アトラスと未来予測手術
胸部外科への臨床応用
Ｍｉｃｒｏ‐ＣＴと肺　ほか）
第５章　多元計算解剖学の将来展望「生きた人体の総合理解にむかって」（人材育成と組織改革）