それは偶然を操り、時を刻む。持ち主を選び、終末を告げる。「やってやるぜ、こいつが告げる“世界の終末”を止めてやる！」１９××年。世界が大戦に揺れる中、極東の島国・日本が突如として消滅。ストリートで生きる少年アーティは、町で起こった暴動に巻き込まれ“クロノメーター”と呼ばれる装置を手にする。その瞬間、世界は新たな“時”を刻み始めた―。大いなる力を秘めたクロノメーターを巡る、各国の思惑。失われた時、記憶。刻一刻と迫る終末の中、出会った世界の運命を握る“鍵”となる少女。タイムリミットは二週間。世界の存亡を賭けた戦いが始まる。