メダカ先生、よみがえる！名古屋帝国大学設立時に、理学部生物学科動物学第二講座を立ち上げたメダカ先生こと山本時男は、その後の日本のメダカ研究をリードし、世界へ発信した。現在も最先端の科学研究に寄与し続ける、メダカに魅せられたサイエンティストたちの物語。

第１部　メダカ先生の教え子とメダカ研究（山本時男先生の想い出とメダカ研究―素晴らしき恩師や先輩に出会えて
會田龍雄先生と山本時男先生を回顧して
メダカはわが友）
第２部　メダカ研究の最近（メダカ学最前線―日本が育てたモデル動物メダカ
メダカの色について考える
東山動物園世界のメダカ館と新種「ティウメダカ」の発見
宇宙を旅した日本のメダカ）
第３部　名古屋大学博物館の企画展の記録（めだかの学校　メダカ先生（山本時男）と名大のメダカ研究
博物学者・山本時男の集めた石と貝
山本時男備忘録と蓑虫山人）