ヒポ号の技術を応用した、潜水艦アンモナイト号に乗ってジオとピピは水深数千メートルの海底に行くことに！目の前さえも見えない暗闇の深海、見えないということは深海には何もいないの？ところがどっこい！深海に着いた彼らの前には、体長１８ｍのダイオウイカやマッコウクジラなどが活躍する、生態系が広がっていた。神秘的だが危険がいっぱいの深海で、サバイバル大冒険。

１章　コン博士の招待
２章　潜水艦アンモナイト号
３章　深海探検
４章　緊急事態、メタンガス噴出
５章　ケーブルの切断
６章　巨大な海洋生物の出現
７章　ダイオウイカとマッコウクジラの対決
８章　深海生物の食事
９章　深海の熱水噴出孔から脱出せよ
１０章　カマスの大群の襲撃
１１章　深海の謎

科学漫画シリーズの２９点目。深海探査艇のトラブルで漂流する主人公。深海の自然や生物の解説を交え楽しみながら知識もつく。『極寒のサバイバル』も発売。