ＳＰＩＲＩＴＳ前線基地に連れてこられた村雨しずかのクローンは、基地にあった銀の髑髏と共鳴し、アマテラスの姿へと変身を遂げた。殺戮を重ね、ＳＰＩＲＩＴＳ基地内を混乱に陥れるアマテラス――。脳裏をよぎる姉の面影に、村雨良は何を思う！？　一方、暗闇大使は、胸中の謀略をついに実行へと移し、勢力図の書き換えに乗り出した。仮面ライダー、バダン、デルザー軍団、三つ巴の激突は、戦場に混沌の渦を描くのか――！？