阿倍野晴克は平凡に憧れる非凡な高校生。かつては父親の作った借金に追われる日々を送っていたが、今はなんと、宇宙からの侵略者から地球を護る秘密組織“サキモリ”の司令官にされてしまっている。今日も授業中に呼び出されては、防衛任務に就くという非日常を送っている。今度で２８６７回目の襲撃してきた侵略者も、地球衛星軌道にいる謎の絶対守護神マシンがあっさりと殱滅して、事は終わったかにみえた。が、宇宙船の破片が狭奇杜市に、現在は使用していない陸上競技場に落下。そして、そこに急成長する巨大な桜に似た樹木が現れた。この意表を突いた侵略に翻弄される“サキモリ”のメンバー達。晴克は市壊滅の危機を救う事が出来るのか！？