１６歳の少女・トリスは収容されていた監房から脱出し、仲間とともに街の外へ向かった。遺伝子繁栄推進局と称する謎の施設に迎え入れられた一行。トリスは施設内で亡き母の手記を渡され、「異端者」の母が過去に下した選択の秘密に迫り始める。そこには何代にもわたる国家的計画が関係していた。彼女たちがかつて所属していた５つの派閥はなぜ形成されたのか、そして、異端者とは一体何者なのか。真実が明かされる！