世界で初めて痛覚を搭載したＶＲゲーム“スピリットアームズ”。そこに入り浸っている高校生、関場宏介の周りには『末次文音』が２人いた。１人はゲーム世界で最大ギルドのマスターであり、聖女と讃えられる少女。そしてもう１人は、入学以来クラスの誰とも話したことがない同級生。相反する２人はとても同一人物とは思えなかったが…。ゲーム内では他の追随を許さない剣士である文音と偶然パーティを組むことになった宏介は、たった２人で碧竜を倒すというクエストを通じて彼女の“秘密”を知ってしまう。その秘密はやがて、スピリットアームズの世界と彼らの現実を揺るがす事件の引き金となっていき―！？