科捜研のエースとして「彼に鑑定できない証拠物なら、他の誰にも鑑定できない」と言わしめた男・土門誠。ある事件をきっかけに科捜研を辞めた土門は、民間の鑑定所を開設する。無駄を嫌い、余計な話は一切しないという奇人ながら、その群を抜いた能力により持ち込まれる不可解な事件を実験データから読み解く。ある日、殺人事件の被告人を調べた二種のＤＮＡ鑑定が持ち込まれる。一方は被告人が犯人であることを示し、他方は彼が犯人でないことを明らかにしていた。客観的な情報から土門は衝撃的な仮説を導き出す―。