地球連邦政府に反旗を翻した“ザンスカール帝国軍”の侵攻により、故郷を追われてしまったウッソとシャクティ。その混乱でふたりは、市民抵抗組織“リガ・ミリティア”のニュング部隊と出会い、行動を共にする。〈ウッソに戦って欲しくない！〉というシャクティの願いも虚しく、ニュング部隊は、ウッソのＮＴ的な閃きに注目し、“Ｖガンダム”のパイロット候補にしてしまう。シャクティのために故郷へ帰るか、それとも戦士としてベスパと戦うか？そんな葛藤の中で、ベスパのＭＳ群の攻撃が始まり、ウッソは、Ｖガンダムで出撃した。ますます白熱する第２弾。