今回の物語は、メタナイトが主人公の特別編！ケーキ作りで有名なシフォン星という星へ向かおうとしていたメタナイトは、とある用事のため、カービィたちのすむプププランドに立ち寄っていた。しかしそのころ、シフォン星ではマローナ姫が行方不明になる事件が起こっていて！？カービィ、デデデ大王たちとともに、急いでシフォン星へと向かうメタナイト。だけど、たどりついた先では意外な展開が待っていた！！小学中級から。