“自分だけのマスターを見つけたい”とあおの下から旅立ったフレームアームズ・ガールたち。ある日、みんなと再会するも迅雷だけがいない。そんなとき、一つの小包があおに届く。この中身はもしや…と思ったら出てきたのは赤い迅雷だった！？迅雷の姉だというＦＡガールは、ずっと妹を探しているが何故か会えていないらしい。姿をみせない迅雷が心配になってきた轟雷たちは、赤い迅雷と一緒になって迅雷を探すことに。そして轟雷は必死になって妹を探す赤い迅雷と一緒に行動するうちに「姉妹」という特別な関係に興味をもちはじめ―。