魔法少女の雪船エリザはある日、誰かの助けを求める声を聞き、その声に導かれるように奇妙な花を発見する。翌日、その花を詳しく調べるために東山陽彩ら私立武良穂のメンバーを連れて再び茂みへと赴くエリザ。しかしそこに目的の花はなく、代わりに並行世界への入り口であるバカアワビが広がっていた！「悪魔が関わっているなら魔法少女として見過ごせない」と並行世界へと乗り込む魔法少女たち。だがそこで待っていたのは、巨大な花の蕾を信仰する滅びかけた村と、エリザによく似た顔の少女だった―！？