３０万人の魂が消失した大災害ＥＲ（アーリー・ラプチャー）より２年。事件の関係者・御影詩希は、沖ノ鳥島メガフロートシティで平凡な日々を送っていた。そんな彼女の前に、ＥＲの黒幕と言われる謎の組織・国際携挙教会が姿を現す。ヨーロッパ、中東、アメリカ…、詩希は兄礼望、友人のアルヴたちとともに世界中で国際携挙教会の野望と戦う！

「アニメミライ２０１３」でアニメ化された『アルヴ・レズル―機械仕掛けの妖精たち―』に待望の続編登場。少女たちは再び闘いの地へ。