宝探しの番組に参加することになった金田一少年。謎の天才学者の館、「錬金術館」で惨劇の幕は上がる。番組スタッフ達が次々に殺害され、彼らを殺した仮面姿の「錬金術師」は姿を消す。そして容疑者として疑われたのは速水玲香！　金田一少年が密室、そして凶器消失のトリック解明に挑む！！