名探偵・金田一耕助の孫である金田一一が通う不動高校に、「放課後の魔術師」から、古い校舎をこわしたら“七つの呪い”が降りかかるという謎の脅迫状がおくられてきた。ミステリー研究会の会長にさそわれて「放課後の魔術師」と「七不思議」の正体を探しはじめた金田一は、「あかずの生物室」で謎の怪人の姿を見たのだった！