バトルシティトーナメントを制して、しばし休息の遊戯達。だが天馬夜行が率いるI2（インダストリアルイリュージョン）社が海馬コーポレーションを乗っ取り、遊戯に魔の手が伸びる。新たな神のカードを持つ天馬に杏子を人質に取られ遊戯は！？