事件から十数年後、エルファバは西方のキアモ・コにいた。一緒に暮らす人からは魔女と呼ばれている。一方、オズの各地では衝突が絶えず、南方で虐殺が行われ、東方でエルファバの妹ネッサローズが総督として圧政を敷いていた。そこへ、竜巻に乗ってドロシーがやって来た。彼女はグリンダに導かれ、魔法使いに会うと、“西の悪い魔女”のもとへ送り込まれる。エルファバは待ち受けていた。運命の時が迫る。