気鋭のプログラマー各務秀則は、なぜ殺されたのか？尊敬する先輩の死の謎を解くため、ネット上に構築された電脳空間「惑星ペルセポネ」にログインした来栖正孝は、秀則が「ペルセポネ」で操っていた分身「ノリリン」もまた仮想世界の中で惨殺されていたことを知る。やがて「ペルセポネ」の美少女「メグ」とともに犯人探しを開始した来栖を、虚実の世界を往来する巨大な悪意が襲う。

人の死までも表現できる精緻な電脳仮想世界で連続殺人が勃発。同じ頃、仮想世界に参加している現実の人間も謎の死を遂げていた。