日本の神々とは日本人にとってどのような存在だったのか。神々は日本の風土のなかでどのような役割を担っているのか。日本の神は、自然を畏敬し国土の安寧を願う出雲系と、天皇による国家支配を正当化する高千穂・日向系に分かれる。高千穂・日向・出雲で景観問題の解決に奔走した著者が神話の舞台を歩き、「古事記」「日本書紀」編纂の場である飛鳥の遺跡に身を置いて、神々の来歴にひそむ謎を解く。

序章　女神はなぜ洞窟に隠れたか―高千穂神話の世界から
第１部　出雲の神々の世界へ（スサノオの国づくりと和歌の起源―出雲平野の「我が心すがすがし」
斐伊川水系大治水計画―昭和・平成のオロチ退治
天下経営の大神―出雲大社表参道神門通りの道づくり
水に臨む神々―城原川流域委員会
疫病神の活躍―鞆の浦まちづくり）
第２部　風土に生きる神々（巨大ナマズと戦う神々―要石とプレートテクトニクス
「ふるさと見分け」の方法―姥ヶ懐・裂田溝の危機
白き山の姫神―在地神と外来神
座問答―古代の大合併と合意形成の知恵
神々誕生の海岸―宮崎海岸侵食対策事業）
第３部　神話から歴史への旅（飛鳥にて―『古事記』『日本書紀』編纂スタートの地
神話と歴史をめぐる三つの疑問
飛鳥浄御原宮―神話と歴史を編む
前例としての日本神話
古代からの伝言―危機の時代のリスクマネジメント）