環境の良い学園と、気心の知れた仲間たちに囲まれ、ぼくは、楽しい学生生活を送っていた。少なくとも、あの事件が起きるまでは…。探偵クラブ部長・神保雷太（中２）。先生を悩ませた怪事件を軽々と解決。さて今度は真夜中に音楽室のピアノが…。

神保雷太は花園学園中学２年生で探偵クラブ部長。「すべての事件には動機がある」と学園の怪事件を仲間と科学的に解明する。