殺人芸術家・ジョーカー、精神科医・ハーレイ・クイン、二人の運命が交差する。凶悪犯罪が絶えないゴッサムシティ。若き精神科医ハーレイ・クインはある夜、ルームメイトの遺体を発見する。そこには謎の連続殺人犯、ジョーカーの痕跡があった。事件は未解決のまま５年の月日が経ち、またしてもジョーカーによる殺人事件が発生してしまう。凶悪犯罪のプロファイラーとしてゴッサム市警に協力するハーレイは、ジョーカーの正体を突き止めようと躍起になるが…。